通勤途中の交通事故の治療で労災保険を使う場合、

「療養給付たる療養の給付請求書」（様式第16号の3）（通勤災害用）を労基署から入手し、事業主の証明を受けた後に労災保険適用の病院に提出します。（労基署ではありません）
これにより、被害者は病院から治療という行為での給付を受け、治療費は病院から労災保険に請求されますので、被害者の金銭的支払は発生しません。

以下は（財）労災保険情報センター提供の、業務災害用の「療養給付たる療養の給付請求書」（様式第16号の3）（通勤災害用）の書式です。